Аркадия моей юности: Бесконечный путь SSX

События разворачиваются после поражения в войне против империи Иллюмидус, которая порабощает и уничтожает обитаемые планеты. Земля полностью перешла под контроль инопланетных захватчиков. Капитан Харлок и его соратники объявлены врагами человечества и изгнаны с планеты. Иллюмидус продолжает преследование, присвоив Харлоку, Тотиро и Эмеральде кодовые номера S-00999, S-00998 и X-00001 соответственно. Эти персонажи объявлены в розыск.

Помимо сопротивления Иллюмидусу, бывшие защитники Земли вынуждены противостоять людям, которые охотятся за вознаграждением, назначенным за их головы. Несмотря на изменившиеся обстоятельства и увеличение числа врагов, Харлок и его команда продолжают свой путь, пытаясь сохранить способность к сопротивлению в условиях, когда против них настроены не только захватчики, но и часть человечества.