Мобильный воин Гандам: Единорог

События разворачиваются в 0096 году вселенского века, через три года после событий «Мобильный воин Гандам: Ответный удар Чара» и за 27 лет до начала «Мобильный воин Гандам Эф-91». Главный герой, студент Академии Анахайм по имени Банаджер Линкс, оказывается втянут в противостояние Земной Федерации и террористической группировки The Sleeved. Причиной конфликта является «Ящик Лапласа» — предмет, который, по слухам, способен изменить ход развития человечества. В день знакомства с Одри Берн Банаджер сталкивается с последствиями этой борьбы.

Сюжет строится вокруг попыток различных сторон завладеть «Ящиком Лапласа». Банаджер постепенно узнаёт о значении артефакта и его связи с историей вселенной. Его действия и решения влияют на исход противостояния, а также на отношения между персонажами. Интрига заключается в том, что содержимое «Ящика» может иметь как разрушительные, так и созидательные последствия, что подталкивает героев к выбору между сохранением статус-кво и радикальными изменениями.